Si optan por módulos, Hacienda les calcula un beneficio en función de una serie de parámetros (superficie del local, nº de trabajadores, potencia eléctrica instalada, etc.) y sobre ese beneficio pagan sus declaraciones. Si obtienen un beneficio mayor del calculado por Hacienda, mejor para ustedes. Si obtienen un beneficio inferior, o pérdidas, peor para ustedes. Siguen pagando sobre el beneficio calculado por Hacienda.
En estimación directa llevan una contabilidad, y pagan en función de los resultados reales de la empresa.
Por tanto, y dado que al iniciar una actividad no suelen obtenerse beneficios elevados, les recomiendo que empiecen en estimación directa y contabilidad, que ya tendrán tiempo de cambiarse a módulos en el futuro si sus beneficios son muy elevados.